Please use this identifier to cite or link to this item: http//localhost:8080/jspui/handle/123456789/223
Title: étude des approche génomiques dans l’estimation du pouvoir métabolique chez les actinomycètes
Authors: بوراس, هناء
مهدي, روفيدة
Keywords: Actinomycetes, secondary metabolites, streptomyces, genomic approaches, genome mining, bioinformatics
Actinomycètes, métabolites secondaires, streptomyces, approches génomiques, Exploration de génome, bio-informatique
الكلمات الرئيسية: األكتينوميسيتس ، األيض الثانوي ، ستريبتوميساس، نهج الجينوم ، استكشاف الجينوم ، المعلوماتية الحيوية
Issue Date: 9-Jan-2021
Abstract: إن األكتينوميسيتس عبارة عن بكتيريا ميسيليلية إيجابية الجرام ، وسادسة الجسيمات عموماً ، ومتغايرة الجسيمات ، وهوائية ، ومتوسطة الجسيمات ، وفي كل مكان ؛ وتصادف في مجموعة متنوعة من المناطق الطبيعية: التربة ، والحطام النباتي ، والرواسب البحرية ، والبحيرات ، والبحار ، والمحيطات. وهي جزيئات حيوية مفرزة مثل اإلنزيمات والفيتامينات والمضادات المناعية ومبيدات الحشرات ومبيدات األعشاب ، كما أن الستربتوميدات هي أفضل المرشحات إلنتاج األيضات الثانوية النشطة بيولوجيا. في هذا البحث ، هدفنا هو دراسة نهج الجينوم المختلفة التي تقدر األيضات الثانوية في األكتينوميسيتس. معظم األيضات الثانوية من األكتينوميسيتس اكتشفت بالطرق الكيميائية لتعديل ظروف الثقافة. يتم التعبير عن العديد من األيضات الثانوية في مستويات منخفضة خالل نمو المختبرات. تبين أن اكتشاف األيض الثانوي الجديد صعب. وقد تم التغلب على هذا التقييد من خالل نهج استكشاف الجينوم ، الذي تم فيه إحراز تقدم مؤخرا في تكنولوجيا تسلسل الحمض النووي واستخدام األدوات الحيوية ) ANTISMASH ،BLAST ،NP الباحث(. س( أدى إلى زيادة سريعة في عدد أيض الجينوم الثانوي وعلى أساس هذا العمل ، ال يمكننا إال اتباع نهج الجينوم األكثر أهمية في تقدير القوة األيضية لألكتينوميسيتس مقارنة باألسلوب التقليدي
Description: Les actinomycètes sont des bactéries mycéliennes à Gram positif, généralement saprophytes, hétérotrophes, aérobies, mésophiles et ubiquitaires ; sont rencontrés sur une grande variété de substrats naturels: sols, débris végétaux, sédiments marins, lacs, mers et océans. Ils sont sécrétées les molécules bioactives telles que, les enzymes, les vitamines, les immunosuppresseurs, les insecticides et les herbicides, et les Streptomyces sont les meilleurs candidats pour la production des métabolites secondaires biologiquement actifs. Dans cette recherche, notre objectif est l’étude des différentes approches génomiques qui estiment les métabolites secondaires chez les actinomycètes La plupart des métabolites secondaires des actinomycètes ont été découverts par des méthodes chimiques consistant à modifier les conditions de culture. De nombreux métabolites secondaires sont exprimés à de faibles niveaux au cours de la croissance en laboratoire. La découverte de nouveaux métabolites secondaires s'est avérée difficile. Cette limitation a été surmontée par une approche d'exploration du génome, dans laquelle les progrès récents de la technologie de séquençage de l'ADN et à l’aide des outils bio-informatiques (antiSMASH, BLAST, NP searcher.. etc) ont entraîné une augmentation rapide du nombre de métabolites secondaires de génomes des actinomycètes de haute qualité. A l’issu de ce travail, nous pouvons conclure que les approches génomiques plus important dans l’estimation de pouvoir métabolique des actinomycètes par rapport à la méthode classique
URI: http//localhost:8080/jspui/handle/123456789/223
Appears in Collections:3.Faculté des Science Exactes et des Sciences de la Nature et de la Vie

Files in This Item:
File Description SizeFormat 
memoire d'actinomycete finale.pdf2,97 MBAdobe PDFView/Open
CCF30062021.pdf1,67 MBAdobe PDFView/Open


Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.