étude des approche génomiques dans l’estimation du pouvoir métabolique chez les actinomycètes

بوراس, هناء; مهدي, روفيدة

Accueil de DSpace
→
03.Doctorat
→
3.Faculté des Science Exactes et des Sciences de la Nature et de la Vie
→
Voir le document

dc.contributor.author	بوراس, هناء
dc.contributor.author	مهدي, روفيدة
dc.date.accessioned	2021-09-23T14:25:50Z
dc.date.available	2021-09-23T14:25:50Z
dc.date.issued	2021-01-09
dc.identifier.uri	http//localhost:8080/jspui/handle/123456789/223
dc.description	Les actinomycètes sont des bactéries mycéliennes à Gram positif, généralement saprophytes, hétérotrophes, aérobies, mésophiles et ubiquitaires ; sont rencontrés sur une grande variété de substrats naturels: sols, débris végétaux, sédiments marins, lacs, mers et océans. Ils sont sécrétées les molécules bioactives telles que, les enzymes, les vitamines, les immunosuppresseurs, les insecticides et les herbicides, et les Streptomyces sont les meilleurs candidats pour la production des métabolites secondaires biologiquement actifs. Dans cette recherche, notre objectif est l’étude des différentes approches génomiques qui estiment les métabolites secondaires chez les actinomycètes La plupart des métabolites secondaires des actinomycètes ont été découverts par des méthodes chimiques consistant à modifier les conditions de culture. De nombreux métabolites secondaires sont exprimés à de faibles niveaux au cours de la croissance en laboratoire. La découverte de nouveaux métabolites secondaires s'est avérée difficile. Cette limitation a été surmontée par une approche d'exploration du génome, dans laquelle les progrès récents de la technologie de séquençage de l'ADN et à l’aide des outils bio-informatiques (antiSMASH, BLAST, NP searcher.. etc) ont entraîné une augmentation rapide du nombre de métabolites secondaires de génomes des actinomycètes de haute qualité. A l’issu de ce travail, nous pouvons conclure que les approches génomiques plus important dans l’estimation de pouvoir métabolique des actinomycètes par rapport à la méthode classique	en_US
dc.description.abstract	إن األكتينوميسيتس عبارة عن بكتيريا ميسيليلية إيجابية الجرام ، وسادسة الجسيمات عموماً ، ومتغايرة الجسيمات ، وهوائية ، ومتوسطة الجسيمات ، وفي كل مكان ؛ وتصادف في مجموعة متنوعة من المناطق الطبيعية: التربة ، والحطام النباتي ، والرواسب البحرية ، والبحيرات ، والبحار ، والمحيطات. وهي جزيئات حيوية مفرزة مثل اإلنزيمات والفيتامينات والمضادات المناعية ومبيدات الحشرات ومبيدات األعشاب ، كما أن الستربتوميدات هي أفضل المرشحات إلنتاج األيضات الثانوية النشطة بيولوجيا. في هذا البحث ، هدفنا هو دراسة نهج الجينوم المختلفة التي تقدر األيضات الثانوية في األكتينوميسيتس. معظم األيضات الثانوية من األكتينوميسيتس اكتشفت بالطرق الكيميائية لتعديل ظروف الثقافة. يتم التعبير عن العديد من األيضات الثانوية في مستويات منخفضة خالل نمو المختبرات. تبين أن اكتشاف األيض الثانوي الجديد صعب. وقد تم التغلب على هذا التقييد من خالل نهج استكشاف الجينوم ، الذي تم فيه إحراز تقدم مؤخرا في تكنولوجيا تسلسل الحمض النووي واستخدام األدوات الحيوية ) ANTISMASH ،BLAST ،NP الباحث(. س( أدى إلى زيادة سريعة في عدد أيض الجينوم الثانوي وعلى أساس هذا العمل ، ال يمكننا إال اتباع نهج الجينوم األكثر أهمية في تقدير القوة األيضية لألكتينوميسيتس مقارنة باألسلوب التقليدي	en_US
dc.description.sponsorship	Actinomycetes are Gram-positive mycelial bacteria, generally saprophytic, heterotrophic, aerobic, mesophilic and ubiquitous; are encountered on a wide variety of natural substrates: soils, plant debris, marine sediments, lakes, seas and oceans. They are secreted bioactive molecules such as enzymes, vitamins, immunosuppressants, insecticides and herbicides, and Streptomyces are the best candidates for the production of biologically active secondary metabolites. In this research, our objective is the study of different genomic approaches that estimate secondary metabolites in actinomycetes. Most of the secondary metabolites of actinomycetes have been discovered by chemical methods consisting in modifying the culture conditions. Many secondary metabolites are expressed at low levels during growth in the laboratory. The discovery of new secondary metabolites has proven to be difficult. This limitation has been overcome by a genome mining approach, in which recent advances in DNA sequencing technology and bioinformatics tools (antiSMASH, BLAST, NP searcher…ect) have resulted in a rapid increase in the number of secondary metabolites from high quality actinomycetes genomes. In the wake of this work, we power that genomic approache more important in the estimation of metabolic power of actinomycetes compared to the classical method	en_US
dc.language.iso	fr	en_US
dc.subject	Actinomycetes, secondary metabolites, streptomyces, genomic approaches, genome mining, bioinformatics	en_US
dc.subject	Actinomycètes, métabolites secondaires, streptomyces, approches génomiques, Exploration de génome, bio-informatique	en_US
dc.subject	الكلمات الرئيسية: األكتينوميسيتس ، األيض الثانوي ، ستريبتوميساس، نهج الجينوم ، استكشاف الجينوم ، المعلوماتية الحيوية	en_US
dc.title	étude des approche génomiques dans l’estimation du pouvoir métabolique chez les actinomycètes	en_US