Caractérisation de la résistance aux antibiotiques des souches d'entérobactéries isolées de divers produits alimentaires

Abstract

La résistance aux antibiotiques des entérobactéries constitue une préoccupation majeure pour la santé publique, en raison de son émergence en communauté et dans la chaine alimentaire. L’objectif de cette étude était d’évaluer la prévalence des entérobactéries résistantes aux

céphalosporines de troisième génération (ERC3G), des entérobactéries productrices de bêta- lactamases à spectre étendu (EBLSE), de céphalosporinases AmpC et de carbapénèmases

(CP) dans divers produits alimentaires, ainsi que de caractériser les gènes de BLSE. L’isolement des ERC3G a été réalisé sur gélose MacConkey supplémentée en céfotaxime, suivi d’une identification par la galerie API 20E. L’antibiogramme a été réalisé selon la méthode des disques et les tests phénotypiques utilisés dans la recherche des β-lactamases étaient : les tests de synergie et du double disque pour les BLSE, le test AmpC pour les céphalosprinases et les tests de Hodge modifié, mCIM et rCDM pour les CP. La PCR standard et le séquençage ont été utilisés pour chercher les gènes BLSE. 341 souches d'entérobactéries ont été isolées à partir de 198/433 échantillons de divers produits alimentaires. Les espèces les plus présentées étaient : E. coli (n=90), K. pneumoniae et En. cloacae (n=36 chacune), Raoultella ornithinolytica (n=31) et Klebsiella oxytoca (n=29). Les souches ont montré des taux de résistance élevés aux β-lactamines, aux quinolones et au cotrimoxazole et 55,72% d’entre elles étaient multirésistantes. Le taux de contamination par les ERC3G, les entérobactéries productrices de BLSE, dʼAmpC et de CP était respectivement de 32,10%, 30,95%, 2,31% et 0,92% des échantillons de divers produits alimentaires analysés, et leur prévalence était de 56.89%, 53,37%, 2,93% et 1,47% des souches isolées avec co-occurrence de BLSE et CP dans 2,60% des souches productrices de β-lactamases. La caractérisation moléculaire a montré la présence d’au moins un gène BLSE (blaCTX-M, blaTEM, blaSHV) chez 7 souches sélectionnées avec occurrence de blaCTX-M chez 6 souches, ainsi que la détection pour la première fois en Algérie des variants rares (blaCTX-M-79, blaCTX-M-107, blaCTX-M-117, blaTEM-112, blaTEM-125, blaTEM-194 et blaSHV-176). Les résultats de notre étude révèlent une contamination des différents produits alimentaires analysés par des entérobactéries résistantes aux antibiotiques, ce qui pose des risques importants au consommateur.